时间:2020年10月29日
地点:机电信息楼
参会人员:储根深、陈丹丹、任帅、白鹤、朱雨晗、陈添翼、杨绍雄、何远杰、李慧昭。
主持人:储根深、陈丹丹
正文:
一、会议主要内容
- 储根深介绍了KMC模拟的基本原理,简单介绍了KMC计算中跃迁速率和时间增量的计算方式;简单介绍了过渡态理论;介绍了KMC的几种实现方式及各自特点;从计算需求上,介绍了MD如何过渡到KMC模拟;介绍了OKMC和AKMC两种方法及各自优缺点;
- 储根深针对AKMC的off-lattice方法进行介绍,大家对于off-lattice的KMC实现进行了讨论,并形成后续工作行动项;
- 陈丹丹介绍了材料组3-5年的工作规划,包括整体工作规划,奖项规划,成果规划,成员各阶段工作规划,大家在工作规划的基础上,详细确认了第一阶段的目标和任务;
- 对上次会议制定的行动项进行了讨论。
二、行动项
上次会议行动项完成情况:
- 理清DeepMD中针对MD模拟的深度学习方法与计算优化的工作流程。
对DeePMD代码结构、工作量进行了分析,下一步对代码展开解读;
- 调研国内外针对模拟大数据的相关工作,以及增加材料、燃料等限定词后是否具有不同的特点与处理方法;
找到了国外对于模拟大数据相关论述的文献,文献中对模拟大数据特点做了归纳(3F),下一步需要对这些文献内容进一步调研和总结
- DeepMD-kit的代码解读:先研究神经网络模型训练部分的代码(python部分)。1. 待有更深入了解后,确定其方法是否可用于MISA-MD 程序以及是否有更有的方案(如机器学习方法是否必须是神经网络?针对MISA-MD的本身数据结构来做,是否比基于lammps的NeighborList来做更简单/更复杂,我们的MD程序是否有优势或者劣势?)。2. 评估其势函数计算复杂性,相对于传统势函数增加了多大的计算量,如何优化或者有无效率更高的机器学习方法?
此行动项在代码解读工作进行到一定程度后再进行探讨。
本次会议形成行动项:
- 深入研究off-lattice具体算法,对其中鞍点搜索算法的计算过程进行详细研究,评估其实现难度和工作量;
- 查找是否有off-lattice的开源KMC软件,进行软件的解读。